A股市场不需要冻结资金，投资者只需要在中签之后交纳足够的资金即可申购。而新三板申购是以全额缴付申购冻结资金的方式。投资者在申购新三板前，需要将足额的申购资金存入其资金账户，但是等获配股数确定后可以将多缴款项退回。
相对于投资门槛较低的A股而言新三板的投资门槛比较高，每个层级投资所需要的入门金额也不同，新三板分为了以下三个层级：
1、精选层：如果投资者选择公众水平较高优质企业的精选层，需要满足100万人民币的资金；
2、创新层：如果想选择初具规模尚处于高速发展期企业的创新层，入门资金则需要满足150万；
3、基础层：是满足了基本挂牌条件中小型企业所在的层次，如果想要投资则需要满足200万的资金。