1、股票定义不同
法人股是以其合法并且可以支配的资产向股份有限公司非上市流通股权部分投资所形成的股份，法人股属于非流通股票。根据投资主体的不同，股权设置有四种形式：国家股、法人股、个人股、外资股；流通股是指上市公司股份中，可以在交易所流通的股份数量，分为A股和B股。
2、股票流动性不同
现有的法人股流动主要有以下几种方式：协议转让、拍卖、质押和回购，流动性相对较差；流通股的全流通方式提高了股市的活跃度。
3、股票持有状态不同
法人股就是由上市公司的企业法人自己内部所持有的内部股票，目前还不能上市交易；流通股则是在股票市场中公开流通的股票，由中国证券监督管理委员会管理。